Jonathan Estrada del América non ha ancora giocato in nessuna delle 24 partite che il suo club ha disputato finora in Liga MX nel 2024/2025.
Nell'ultima stagione con CA La Paz in Liga de Expansión MX Estrada ha collezionato 31 presenze.
Prima di cominciare l'esperienza con il Club América nel giugno 2024, il portiere ha collezionato 42 presenze in campionato con CA La Paz.