Milson Marítimo è sceso in campo nella maggior parte delle gare del club in Primeira Liga nel 2020/2021, avendo collezionato 21 presenze, per un totale di 626 minuti. É partito titolare in 5 presenze su 34 giornate ed è stato utilizzato spesso come subentrato, in 16 occasioni.
La sua ultima partita in campionato risale al 19 maggio, gara in cui ha giocato 20 minuti con la maglia Marítimo contro Sporting CP, nella sconfitta per 5-1. In totale il centrocampista ha segnato 1 rete in questa stagione; ha inoltre fornito 1 assist. Ha ricevuto 1 cartellino rosso.
Il suo primo gol nel campionato è arrivato in una sconfitta 2-1 contro Sporting Braga il 7 gennaio.
Milson ha giocato 6 partite di Primeira Liga nell'ultima stagione con Marítimo, fornendo 1 assist.