Leonardo Sequeira ha giocato la maggior parte delle partite della sua squadra in Liga MX nel 2022/2023, avendo collezionato 13 presenze, per un totale di 1004 minuti. É partito titolare in 11 di queste presenze, su 17 giornate, ed è entrato a gara in corso 2 volte.
Il centrocampista ha collezionato la sua ultima presenza il 2 ottobre, con il Querétaro FC: una sconfitta per 4-1 contro il Deportivo Toluca, in cui ha giocato 76 minuti.
Sequeira ha giocato 16 partite di Liga MX nell'ultima stagione con il Querétaro FC, realizzando 4 gol e fornendo 2 passaggi vincenti.
Sequeira ha iniziato la sua esperienza in prestito con il Querétaro FC nel gennaio 2022. In precedenza giocava per , per cui ha collezionato 67 presenze in campionato, con 4 gol e 1 assist, dopo aver raggiunto il club nell'agosto 2017.