Jonathan Pérez è un difensore del Santos Laguna che è sceso in campo nella maggior parte delle gare del club in Liga MX nel 2024/2025, avendo collezionato 10 presenze, per un totale di 713 minuti. É stato scelto nell'11 iniziale in 8 presenze su 17 giornate ed è entrato 2 volte.
La sua ultima presenza nella competizione risale all'8 novembre, con la maglia del Santos Laguna contro il Querétaro FC. In quella partita ha segnato un gol nonostante la sconfitta per 3-2. In totale il difensore ha realizzato 1 rete in questa stagione.
Pérez non ha giocato nemmeno una partita di Liga MX nell'ultima stagione con il Club Santos Laguna.
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