Eduardo Aguirre, attaccante del Atlas, è sceso in campo in ogni sfida di Liga MX del 2024/2025, 17 volte da titolare e 2 a gara in corso.
La sua ultima partita in Liga MX risale al 24 novembre, partita in cui ha giocato 70 minuti con la maglia del Atlas contro il Tijuana, nella sconfitta per 3-0. In totale l'attaccante ha segnato 4 reti in questa stagione - primo tra i giocatori della propria squadra.
É stato contro il Cruz Azul il 6 novembre che Aguirre ha segnato il suo ultimo gol, nel pareggio 2-2. Ha aperto le sue marcature in questo campionato contro il Fútbol Club Juárez il 5 luglio, avendo realizzato una rete nel pareggio 2-2.
Nella passata stagione di Liga MX Aguirre è sceso in campo in 26 partite con il CF Atlas Guadalajara, gare in cui ha realizzato 7 gol e fornito 2 assist.
A giugno 2023 Aguirre, in quel periodo giocatore del Santos Laguna, ha iniziato a giocare per il CF Atlas Guadalajara in prestito. Ha collezionato 108 presenze in campionato in totale con il Club Santos Laguna, realizzando 20 gol e fornendo quattro assist. Il suo passaggio a giocatore del Atlas è stato definitivo a luglio 2024.