Eduard Spertsyan Krasnodar non ha preso parte a molte delle gare della sua squadra in Premier League nel 2020/2021, avendo collezionato 5 presenze, per un totale di 139 minuti. È partito titolare in 2 di queste presenze su 29 giornate ed è stato frequentemente utilizzato come subentrato, in 3 occasioni.
Spertsyan ha collezionato la sua ultima presenza il 13 dicembre, con Krasnodar: una vittoria per 5-0 contro Lokomotiv Moskva, in cui ha giocato solo 8 minuti.
Spertsyan ha giocato 1 partita di PFL nell'ultima stagione con Krasnodar III.
Spertsyan ha iniziato la sua esperienza con Krasnodar nel settembre 2020, mentre prima giocava con Krasnodar II, con cui ha collezionato 74 presenze in campionato, con 17 gol segnati.