Alfredo Morales è un centrocampista del San Jose Earthquakes che ha giocato nella maggior parte delle partite della sua squadra in MLS nel 2024, avendo collezionato 23 presenze, per un totale di 633 minuti. É partito titolare in 4 presenze su 34 giornate ed è stato utilizzato frequentemente come subentrato, in 19 occasioni.
Il centrocampista ha collezionato la sua ultima presenza il 5 ottobre, con i San Jose Earthquakes: una sconfitta per 1-0 contro il Real Salt Lake, in cui ha giocato 15 minuti.
Nella passata stagione di MLS Morales ha giocato 22 partite con il New York City, gare in cui ha fornito 1 assist vincente.
Prima di arrivare a vestire la maglia del San Jose Earthquakes nel gennaio 2024, il centrocampista ha collezionato 77 presenze in campionato con il New York City, per un totale di 7 assist.